Protein–RNA interactions for Protein: P20334

Tnfrsf9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf9P20334 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tnfrsf9P20334 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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