Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
P20040 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
P20040 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P20040 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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