Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NefhP19246 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NefhP19246 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NefhP19246 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NefhP19246 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NefhP19246 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NefhP19246 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NefhP19246 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NefhP19246 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NefhP19246 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NefhP19246 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NefhP19246 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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NefhP19246 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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NefhP19246 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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NefhP19246 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NefhP19246 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
NefhP19246 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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NefhP19246 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NefhP19246 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NefhP19246 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NefhP19246 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NefhP19246 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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NefhP19246 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NefhP19246 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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NefhP19246 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NefhP19246 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NefhP19246 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NefhP19246 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NefhP19246 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NefhP19246 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NefhP19246 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NefhP19246 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NefhP19246 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NefhP19246 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NefhP19246 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NefhP19246 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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