Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18530 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
P18530 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
P18530 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
P18530 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms