Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PcnaP17918 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PcnaP17918 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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