Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RaraP11416 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaraP11416 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaraP11416 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RaraP11416 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RaraP11416 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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