Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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H2-Eb1P04230 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-Eb1P04230 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-Eb1P04230 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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H2-Eb1P04230 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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