Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01649 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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P01649 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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P01649 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01649 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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