Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BlmO88700 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BlmO88700 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BlmO88700 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BlmO88700 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BlmO88700 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BlmO88700 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms