Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Foxq1O70220 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms