Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TsksO54887 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TsksO54887 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TsksO54887 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms