Protein–RNA interactions for Protein: O35136

Ncam2, Neural cell adhesion molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncam2O35136 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ncam2O35136 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms