Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdcbpO08992 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdcbpO08992 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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