Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ube3aO08759 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ube3aO08759 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube3aO08759 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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