Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm20939L7N243 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20939L7N243 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms