Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8356J3QPD3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8356J3QPD3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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