Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm2035J3QP87 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm2035J3QP87 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms