Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim18J3QNP2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms