Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6594J3QM43 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms