Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cldn34c3J3QJW5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms