Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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