Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28048F7BCN0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms