Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8005F6YKY3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms