Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17555F6U8B9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms