Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Rnf212F6TQD1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms