Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3020E9Q3J7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3020E9Q3J7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3020E9Q3J7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3020E9Q3J7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3020E9Q3J7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3020E9Q3J7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3020E9Q3J7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3020E9Q3J7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3020E9Q3J7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3020E9Q3J7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms