Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atad2bE9Q166 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atad2bE9Q166 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atad2bE9Q166 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atad2bE9Q166 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms