Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gcn1E9PVA8 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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