Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Rnf217D3YYI7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rnf217D3YYI7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms