Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samd1D3YXK1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms