Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clrn2B2RVW2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Clrn2B2RVW2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Clrn2B2RVW2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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