Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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