Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms