Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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PtprbB2RU80 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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PtprbB2RU80 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtprbB2RU80 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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PtprbB2RU80 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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