Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rrn3B2RS91 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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