Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ssxb8B1AY40 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssxb8B1AY40 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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