Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik3B1AS29 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms