Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Odf2A3KGV1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf2A3KGV1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms