Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Atp8b5A3FIN4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Atp8b5A3FIN4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Atp8b5A3FIN4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Atp8b5A3FIN4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Atp8b5A3FIN4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Atp8b5A3FIN4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Atp8b5A3FIN4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp8b5A3FIN4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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