Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprfA2A8L5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprfA2A8L5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprfA2A8L5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprfA2A8L5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprfA2A8L5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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PtprfA2A8L5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprfA2A8L5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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