Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms