Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm3550W4VSN7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3550W4VSN7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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