Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcniQ9Z2V9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms