Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd3Q9Z2D8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms