Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms