Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc2Q9R244 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trpc2Q9R244 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Trpc2Q9R244 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trpc2Q9R244 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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