Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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