Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc3Q9QZC1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trpc3Q9QZC1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trpc3Q9QZC1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trpc3Q9QZC1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trpc3Q9QZC1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc3Q9QZC1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc3Q9QZC1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc3Q9QZC1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trpc3Q9QZC1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trpc3Q9QZC1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms