Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trim44Q9QXA7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trim44Q9QXA7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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