Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tgm1Q9JLF6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tgm1Q9JLF6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tgm1Q9JLF6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Tgm1Q9JLF6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tgm1Q9JLF6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms